طبخ غذا در فرهای اجاق مایکروویو کوتاه است و میکروب‌هایی که احتمالاً در غذا وجود داشته کشته نمی‌شوند و برای سلامتی می‌تواند مضر باشد. روش‌های سریع پخت اثر سرطان زایی دارد زیرا هرچه مواد غذایی سریع تر و با درجه حرارت بالاتر پخته شود، مواد سرطان زایی بیشتر می‌شود. به عنوان مثال اگر گوشت را سریع بپزیم اثر سرطان زایی آن تشدید می‌شود.

همچنین این دستگاه برای سالم ماندن نیاز به تمیز شدن مداوم دارد زیرا مواد غذایی که درون ماکروفر برای گرم شدن قرار می‌گیرد بر اثر حرارت، روغن و یا آب موجود در آن‌ها به دیواره‌های دستگاه می چسبد لذا بهتر است هر دو روز یکبار با یکپارچه نم دار داخل بدنه آن تمیز شود. البته بهتر است از ظروف درب دار برای گرم کردن غذا استفاده شود.

سینی مایکروویو